अपने कार्यक्रमों को अधिक से अधिक लोगों तक पहुंचाने के उद्देश्य से राष्ट्रीय समाज रक्षा संस्थान का बाल संरक्षा संभाग केंद्र तथा राज्य सरकारों के विभिन्न विभागों जैसे समाज कल्याण विभाग, महिला एवं बाल विकास विभाग, पुलिस, खुफिया विभाग  आदि के साथ सहयोग करता है। समाज रक्षा से संबंधित विभिन्न संस्थाओंअकादमीविश्वविद्यालयों  के साथ भी यह सहयोग करता है। इनमें से कुछ प्रमुख हैं-